Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms