Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC44A4Q53GD3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC44A4Q53GD3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms