Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFTN2Q52LD8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RFTN2Q52LD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms