Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC38Q502W7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC38Q502W7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms