Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP13-3Q3SY46 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms