Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTLL9Q3SXZ7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms