Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD55Q3KP44 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms