Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TWISTNBQ3B726 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TWISTNBQ3B726 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms