Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC57Q2TAC2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms