Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MICAQ29983 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MICAQ29983 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MICAQ29983 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
MICAQ29983 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MICAQ29983 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MICAQ29983 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MICAQ29983 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MICAQ29983 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MICAQ29983 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MICAQ29983 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MICAQ29983 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MICAQ29983 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MICAQ29983 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MICAQ29983 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MICAQ29983 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MICAQ29983 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MICAQ29983 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MICAQ29983 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MICAQ29983 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MICAQ29983 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MICAQ29983 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MICAQ29983 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MICAQ29983 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MICAQ29983 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MICAQ29983 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MICAQ29983 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MICAQ29983 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MICAQ29983 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MICAQ29983 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MICAQ29983 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MICAQ29983 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MICAQ29983 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms