Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTL8BQ17RB0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RTL8BQ17RB0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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