Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCK2Q16822 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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