Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLPPQ16740 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLPPQ16740 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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