Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SGCBQ16585 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SGCBQ16585 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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