Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP35Q16560 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRNP35Q16560 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
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