Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
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