Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP11Q15643 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIP11Q15643 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
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