Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDSNQ15517 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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