Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP1Q15431 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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