Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNN3Q15417 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNN3Q15417 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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