Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RYR3Q15413 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RYR3Q15413 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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