Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SF3B3Q15393 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
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