Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RABEP1Q15276 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
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RABEP1Q15276 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RABEP1Q15276 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABEP1Q15276 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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