Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFRLQ15198 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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