Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB3GAP1Q15042 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3GAP1Q15042 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
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