Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCLAFQ15004 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PCLAFQ15004 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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