Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB39AQ14964 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB39AQ14964 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB39AQ14964 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB39AQ14964 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB39AQ14964 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms