Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MDC1Q14676 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MDC1Q14676 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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