Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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GBX1Q14549 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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GBX1Q14549 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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GBX1Q14549 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GBX1Q14549 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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GBX1Q14549 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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GBX1Q14549 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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GBX1Q14549 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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GBX1Q14549 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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GBX1Q14549 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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GBX1Q14549 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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GBX1Q14549 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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GBX1Q14549 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBX1Q14549 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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