Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSHL1Q14406 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms