Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CIRBPQ14011 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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