Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CACNA1CQ13936 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNA1CQ13936 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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