Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRR1Q13601 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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