Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CAMK2DQ13557 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAMK2DQ13557 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms