Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTM1Q13496 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTM1Q13496 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTM1Q13496 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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