Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD4Q13485 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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