Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3B2Q13367 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3B2Q13367 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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