Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPA4Q13156 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RPA4Q13156 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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