Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPS1Q13098 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPS1Q13098 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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