Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF1Q13077 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF1Q13077 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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