Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXF2Q12947 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXF2Q12947 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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