Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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