Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN2Q12907 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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