Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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