Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TROQ12816 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TROQ12816 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TROQ12816 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TROQ12816 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TROQ12816 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TROQ12816 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TROQ12816 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TROQ12816 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TROQ12816 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TROQ12816 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TROQ12816 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TROQ12816 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TROQ12816 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TROQ12816 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TROQ12816 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TROQ12816 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TROQ12816 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TROQ12816 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TROQ12816 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TROQ12816 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TROQ12816 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TROQ12816 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TROQ12816 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TROQ12816 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TROQ12816 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TROQ12816 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TROQ12816 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TROQ12816 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TROQ12816 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TROQ12816 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TROQ12816 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TROQ12816 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TROQ12816 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TROQ12816 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TROQ12816 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TROQ12816 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TROQ12816 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TROQ12816 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TROQ12816 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TROQ12816 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TROQ12816 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TROQ12816 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TROQ12816 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TROQ12816 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TROQ12816 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TROQ12816 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TROQ12816 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TROQ12816 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TROQ12816 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TROQ12816 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TROQ12816 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TROQ12816 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TROQ12816 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TROQ12816 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TROQ12816 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TROQ12816 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
TROQ12816 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TROQ12816 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TROQ12816 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TROQ12816 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TROQ12816 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TROQ12816 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TROQ12816 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TROQ12816 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TROQ12816 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TROQ12816 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TROQ12816 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TROQ12816 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TROQ12816 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TROQ12816 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TROQ12816 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TROQ12816 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TROQ12816 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TROQ12816 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TROQ12816 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TROQ12816 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TROQ12816 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TROQ12816 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TROQ12816 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TROQ12816 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TROQ12816 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TROQ12816 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TROQ12816 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TROQ12816 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TROQ12816 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TROQ12816 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TROQ12816 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
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