Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TWF1Q12792 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWF1Q12792 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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