Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNMA1Q12791 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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