Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NUP160Q12769 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NUP160Q12769 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
NUP160Q12769 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NUP160Q12769 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NUP160Q12769 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
NUP160Q12769 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NUP160Q12769 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP160Q12769 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.2■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms