Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 PBA1YLR199C 831 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 FOL3YMR113W 1284 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YNL035CYNL035C 1170 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 CAT5YOR125C 702 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YPR098CYPR098C 486 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 APN2YBL019W 1563 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 AMD1YML035C 2433 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 BAP2YBR068C 1830 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 ATE1YGL017W 1512 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 HMRA2YCR096C 360 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 SPT2YER161C 1002 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YIL060WYIL060W 435 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YIL175WYIL175W 318 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 SDO1YLR022C 753 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 SEN34YAR008W 828 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 HOR7YMR251W-A 180 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YKL075CYKL075C 1353 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 MEC3YLR288C 1425 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YME1YPR024W 2244 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 VTH1YIL173W 4650 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 VTH2YJL222W 4650 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 APS3YJL024C 585 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 RPL17AYKL180W 555 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YLR297WYLR297W 390 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 PHO80YOL001W 882 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 snR17asnR17a 333 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YPL197CYPL197C 414 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 RRP9YPR137W 1722 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 PMS1YNL082W 2622 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 ALD2YMR170C 1521 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 TDA3YHR009C 1572 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 GCR2YNL199C 1605 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 BNA7YDR428C 786 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YDR535CYDR535C 501 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 SMB1YER029C 591 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 TAM41YGR046W 1158 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 MRPL9YGR220C 810 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YJL169WYJL169W 369 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YLR224WYLR224W 1110 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 RAD33YML011C 534 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 ADF1YCL058W-A 342 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 FAT3YKL187C 2253 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 RNR3YIL066C 2610 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 SCT1YBL011W 2280 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YDR053WYDR053W 396 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 DPP1YDR284C 870 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 HNT2YDR305C 654 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 RGI1YER067W 486 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 GET1YGL020C 708 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YLR050CYLR050C 486 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YLR290CYLR290C 834 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 COX7YMR256C 183 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 PDX3YBR035C 687 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 CWC27YPL064C 906 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 ORC4YPR162C 1590 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 MOT2YER068W 1764 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 SEO1YAL067C 1782 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 UBX2YML013W 1755 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 VTC2YFL004W 2487 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 RTK1YDL025C 1863 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 TVP15YDR100W 432 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 PEX4YGR133W 552 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 SPH1YLR313C 1593 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 BER1YLR412W 825 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YMR018WYMR018W 1545 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 MSS1YMR023C 1581 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 SWS2YNL081C 432 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 UBP16YPL072W 1500 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 RPS9AYPL081W 594 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 MRPS5YBR251W 924 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 HPF1YOL155C 2904 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 CTK1YKL139W 1587 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 SNU56YDR240C 1479 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 RNT1YMR239C 1416 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 ADE12YNL220W 1302 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YCL068CYCL068C 783 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 snR8snR8 190 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 RPL9AYGL147C 576 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 CBP4YGR174C 513 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 GEP5YLR091W 882 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 ARV1YLR242C 966 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YML018CYML018C 1182 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 YNL181WYNL181W 1224 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 RPA49YNL248C 1248 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1A-NL1Q12391 TKL1YPR074C 2043 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 PDC1YLR044C 1692 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 ERG11YHR007C 1593 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 RAD28YDR030C 1521 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 ARP9YMR033W 1404 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YDL163WYDL163W 303 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 SWF1YDR126W 1011 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YEL077CYEL077C 3834 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 PRE9YGR135W 777 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 ECL1YGR146C 636 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt5.08□□□□□ -1.6
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