Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 MGA1YGR249W 1371 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 TMA19YKL056C 504 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 JEN1YKL217W 1851 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 ISM1YPL040C 3009 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 RPS9BYBR189W 588 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 NSP1YJL041W 2472 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 LCB5YLR260W 2064 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 TOS8YGL096W 831 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 YGR219WYGR219W 342 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 YUH1YJR099W 711 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 MCK1YNL307C 1128 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 TIR2YOR010C 756 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 DAP2YHR028C 2457 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 MDN1YLR106C 14733 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 DSL1YNL258C 2265 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 PRM15YMR278W 1869 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 GPI1YGR216C 1830 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 SUC2YIL162W 1599 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 YGR117CYGR117C 1431 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 DAN4YJR151C 3486 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 HMS1YOR032C 1305 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 RPC11YDR045C 333 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 SAY1YGR263C 1275 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 CAP2YIL034C 864 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 MTR2YKL186C 555 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 TFA2YKR062W 987 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 MED7YOL135C 669 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 MCM16YPR046W 546 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 SPA2YLL021W 4401 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 ULP1YPL020C 1866 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 COP1YDL145C 3606 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 RAD4YER162C 2265 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 TMA108YIL137C 2841 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 ATG21YPL100W 1491 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 TSR1YDL060W 2367 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 FAS1YKL182W 6156 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 BMH1YER177W 804 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 OKP1YGR179C 1221 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 ANB1YJR047C 474 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 IRC14YOR135C 342 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 SPS4YOR313C 1017 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 OPY1YBR129C 987 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 BMT2YBR141C 1014 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 RIB5YBR256C 717 nt3.54□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 TRS120YDR407C 3870 nt3.53□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 URA2YJL130C 6645 nt3.53□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 YLR352WYLR352W 2424 nt3.53□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 VPS53YJL029C 2469 nt3.53□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 RPA135YPR010C 3612 nt3.53□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 HDA2YDR295C 2025 nt3.53□□□□□ -1.84
LDB17Q12342 WBP1YEL002C 1293 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 YHL026CYHL026C 948 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 LSM12YHR121W 564 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 SHH3YMR118C 591 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 RFC3YNL290W 1023 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 SIL1YOL031C 1266 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 TMA16YOR252W 537 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 YOR314WYOR314W 330 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 TAF14YPL129W 735 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 DSN1YIR010W 1731 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 YOL019WYOL019W 1656 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 CUE3YGL110C 1875 nt3.52□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 MEF1YLR069C 2286 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 HEF3YNL014W 3135 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 NEM1YHR004C 1341 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 CLB5YPR120C 1308 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 SLA1YBL007C 3735 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 YDL026WYDL026W 312 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 BSC1YDL037C 987 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 RPA14YDR156W 414 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 MPC1YGL080W 393 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 MTC3YGL226W 372 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 SPT4YGR063C 309 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 IMP1YMR150C 573 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 LDS2YOL047C 1071 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 PLP2YOR281C 861 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 YPL168WYPL168W 1293 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 AGA1YNR044W 2178 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 ETP1YHL010C 1758 nt3.51□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 YCR007CYCR007C 720 nt3.5□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 RPS8BYER102W 603 nt3.5□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 ERP1YAR002C-A 660 nt3.5□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 RAD10YML095C 633 nt3.5□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 RPS8AYBL072C 603 nt3.5□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 YFL040WYFL040W 1623 nt3.5□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 MIC60YKR016W 1623 nt3.5□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 CTK1YKL139W 1587 nt3.5□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 MTH1YDR277C 1302 nt3.49□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 KIN3YAR018C 1308 nt3.49□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 BYE1YKL005C 1785 nt3.49□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 MTR4YJL050W 3222 nt3.49□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 RPS14AYCR031C 414 nt3.49□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 MGT1YDL200C 567 nt3.49□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 ADH4YGL256W 1149 nt3.49□□□□□ -1.85
LDB17Q12342 SOD1YJR104C 465 nt3.49□□□□□ -1.85
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